诺迦奥特曼在土星与宇宙魔王雷电哥斯拉激烈交战，因为对方力量强大而陷入困境，关键时刻奥特之王出现封印怪兽并带走诺迦奥特曼。诺迦奥特曼在光之国接收特训。一年后，地球受一年前土星的那场战斗影响而导致怪兽频现，宇宙和平联盟成立，精英进击队组建。队长林浩在一次意外中与诺迦奥特曼融为一体。随着战斗的进行，林浩的队友们逐渐察觉到了他的身份异常。在一次危急关头，林浩为了拯救队友，不得不当着他们面变身成诺迦奥特曼，他的身份因此被队友知晓。之后，队友们虽然震惊，但依然选择与林浩并肩作战，为保护地球而努力。然而，战斗并不顺利，诺迦奥特曼遭遇多次战败，也在战斗中不断切换和掌握新的形态。在第九十八章，宇宙魔王雷电哥斯拉冲破封印来到地球，诺迦奥特曼不敌。第九十九章，队长和反叛者身份的双重暴露，诺迦奥特曼再次战败。最终在第一百章，诺迦奥特曼觉醒究极形态，与精英进击队共同战胜黑暗邪神奥特曼和宇宙魔王雷电哥斯拉。在与怪兽的战斗中，精英进击队的三架战斗机“星辰号”、“雷霆号”、“幻影”号也发挥了重要作用，配合诺迦奥特曼对怪兽进行攻击和牵制。防卫

两位毕业大学生阴差阳错穿越时空，来到了有奥特战士的世界，在穿越时空过程中，意外和女友失去了联系，此时，正是梦比优斯奥特曼和希卡利奥特曼击败暗黑大皇帝安培拉星人的第二年，其中一位大学生加入了防卫队GUYSJAPAN。并夺得了奥特战士的力量，另一位大学生因错误的拥有奥特战士的力量，认为自己最强，此时，魔族为了统治宇宙对各个星球，包括地球发动了侵略，但最终被合作的两位奥特战士击败，但是，怪兽还是不断地接连出现，这究竟是怎么回事？怪兽不断出现的原因究竟是什么？是谁在幕后操控这这一切。

在二十五年前，雷克斯奥特曼正在追逐远古巨龙怪兽龙畏斯过程中。雷克斯奥特曼与远古巨龙怪兽龙畏斯相撞，由于撞击力度太大，再加上远古巨龙怪兽龙畏斯是头巨型怪兽，雷克斯奥特曼掉入了正在燃烧着的太阳里面，火焰使其融化，化为了离子，但在这瞬间，雷克斯奥特曼用仅剩的能量将远古巨龙怪兽龙畏斯封印，但没有完全封印，使邪恶的气息外露复活了一部分怪兽，复活的怪兽开始作乱，先是出现在东京的宇宙怪兽百慕拉，再是出现在帕拉吉古城的磁力怪兽安东拉，为了抵抗怪兽作乱，地球防卫组织UNVER成立了怪兽特殊防卫队“tio”。