两位毕业大学生阴差阳错穿越时空，来到了有奥特战士的世界，在穿越时空过程中，意外和女友失去了联系，此时，正是梦比优斯奥特曼和希卡利奥特曼击败暗黑大皇帝安培拉星人的第二年，其中一位大学生加入了防卫队GUYSJAPAN。并夺得了奥特战士的力量，另一位大学生因错误的拥有奥特战士的力量，认为自己最强，此时，魔族为了统治宇宙对各个星球，包括地球发动了侵略，但最终被合作的两位奥特战士击败，但是，怪兽还是不断地接连出现，这究竟是怎么回事？怪兽不断出现的原因究竟是什么？是谁在幕后操控这这一切。

在二十五年前，雷克斯奥特曼正在追逐远古巨龙怪兽龙畏斯过程中。雷克斯奥特曼与远古巨龙怪兽龙畏斯相撞，由于撞击力度太大，再加上远古巨龙怪兽龙畏斯是头巨型怪兽，雷克斯奥特曼掉入了正在燃烧着的太阳里面，火焰使其融化，化为了离子，但在这瞬间，雷克斯奥特曼用仅剩的能量将远古巨龙怪兽龙畏斯封印，但没有完全封印，使邪恶的气息外露复活了一部分怪兽，复活的怪兽开始作乱，先是出现在东京的宇宙怪兽百慕拉，再是出现在帕拉吉古城的磁力怪兽安东拉，为了抵抗怪兽作乱，地球防卫组织UNVER成立了怪兽特殊防卫队“tio”。