《生态系统建设关键技术研究与应用》主要在自然经济概况、社会经济概况和水系生态现状以及制约因素的分析的基础上，通过水系生态系统健康评价技术研究、水系生态建设理论研究、生态河道治理技术和模式研究、水土流失防治技术和模式研究、雨洪水资源利用技术和模式研究、水系连通及调度利用技术和模式的研究、半岛湿地生态功能修复技术和模式研究以及海陆界面水系生态治理技术和模式研究，总结了水系生态系统建设的关键技术。